Хотя большинство территорий Младшего и Среднего жузов в конце XVIII - начав XIX в. вошло в состав России, часть казахских земель оставалась зависимой от среднеазиатских ханств.
Однако и после принятия Младшим жузом подданства России положение в казахском обществе оставалось напряженным. Угроза непредвиденных вторжений в пределы Среднего и Старшего жузов сохранялась. В конце 1733 г. посланцы Старшего жуза Аралбай и Оразгельды прибыли к Абулхаиру с просьбой ходатайствовать перед российской императрицей о принятии Старшего жуза в российское подданство. В это же время султаны и бии Старшего жуза Кодар-бий, Толе-бий, Сатай-батыр, Хангельды-батыр и Болек-батыр обратились непосредственно к императрице с просьбой принять их в свое подданство. Анна Иоанновна 10 июня 1734 г. подписала указ о принятии казахов Старшего жуза в российское подданство. Указ был направлен Абулхаиру, хана Старшего жуза Жолбарыса пригласили в устье реки Ори для принятия присяги. Хан Жолбарыс в свою очередь сообщал о возможности активизации русско-среднеазиатской торговли и обещал охрану торговых караванов. 19 сентября 1738 г. императрица грамотой подтвердила принятие Старшего жуза в состав России. Однако удаленность региона от России, сложная внешнеполитическая обстановка отодвинули на более позднее время осуществление этого акта, но уже насильственным путем. Складывались политические предпосылки для вхождения Семиречья в cocтав России. Еще в 1817 г. султан Суйк Абылайулы принял российское подданство вместе с 66 тыс. человек племени жалаир. Если в начале XIX в. хивинские и кокандские ханы ограничивались набегами на казахов и киргизов, то в 30-40-е годы они пытакхгся предотвратить вхождение юга Казахстана в состав России или хотя бы задержать этот процесс. Укрепления Актау, Алатау, Капал, Сергиополь, Лепсинск стали опорными пунктами России для продвижения в Заилийский край. В 20-30-х годах XIX в. был создан Азиатский комитет. В 1825 г. казахи Уйсунской волости численностью в 50 000 человек дали согласие на открытие округа. Приход русского отряда летом 1846 г. в долину р. Кызылагаш. строительство укрепления Капал в 1847 г. ускорили обращение во власть Российской империи казахов в междуречье Лепсы и Или, а также 40 000 киргизских семей с манапами Жантаем, Жангаром и Ормоном. В январе 1848 г. в Старший жуз был назначен российский пристав. Пользуясь антикокандскими настроениями казахов южных районов и киргизов, сюда продвигаются русские отряды. Крепость Таушубек - опорный пункт кокандцев в низовьях р. Каскелен сдалась отряду подполковника Карбышева в 1851 г. На западе военные действия под командованием оренбургского генерал-губернатора завершились в 1853 г. взятием крепости Ак-Мечеть. В 1854 г. Гасфорт поручил возвести несколько пикетов между реками Коксу и Или в 1858 г. Пристав Старшего жуза майор М.Перемышльский на месте впадения р. Талгар в р. Или. в 1853 г. возвел Илийский пикет, а в 1854 г. основал укрепление Верный на месте казахского поселения Алматы. Возведение укрепления Верный повлияло на жизнь киргизов, в 1855 г. киргизский род буты принял подданство России. Через Верный распространялось экономическое и политическое влияние России в долинах рек Чу и Талас. Перевод в 1855 г. пристава Старшего жуза из Капала в Верный сделало Верный главным поселением Семиреченского края. Верный превратился в один из центров сосредоточения переселенцев в Семиреченском крае. Возведение укрепления Верный в 50-х годах XIX в. ускорило присоединение южных областей Казахстана и киргизских земель к России. Для усиления давления на Кокандское ханство и укрепления политического влияния в долину р. Чу были направлены русские отряды. Возведенное в 1859 г. в пограничном районе Старшего жуза и Северного Киргизстана Укрепление Кастек стало одним из опорных пунктов России в этом регионе. В 1860 г. отряд под полковника Циммермана вошел в Чуйскую долину, был взят Токмак и Питлпек. Султан Садык. сына Кенесары, боролся против русских войск. 19-21 октября 1860 г. вблизи Узынагаша кокандские войска были разбиты начальником Алатауского округа Г.А. Кашаковским. Узынагашская битва показала военную слабость Коканда. Казахи от Аулие-Аты, Шымкента и Ташкента стали откочевывать в районы, уже вошедшие в состав Российской империи. В 1863 г. российское подданство приняли 4000семей рода конырат и 5000 семей рода бестанбалы. В октябре 1862 г. русскими войсками вторично был взят Пишпек. Новое мощное наступление русских войск началось весной 1864 г. Из Верного вышли войска полковника Черняева, которые штурмом взяли Аулие-Ату, Ак Мечеть, Туркестан Мерке. 22 сентября 1864 г. взят Шымкент.Русские войска в июле 1865 г. овладели Ташкентом - крупным политическим и экономическим центром всего Туркестана. По соглашению 1868 г, казахские территории, ранее подчинявшиеся Коканду, отошли к Российской империи и были подчинены туркестанскому генерал-губернатору.
