Типы ферментативных реакций. Механизмы 2-х субстратных реакций. Механизм ферментативного действия пиридоксаль-зависимого фермента аланинаминотрансферазы.

1) Односубстратная

AB= A + B односубстратные 2-хпродуктные

A→B односубстратные однопродуктные (изомеризация)

2) Двусубстратные (большинство)

AB↔CD

В зависимости от последовательности

По механизму протекания

1) Механизм двойного замещения («пинг-понг»)

2) последовательный механизм

Механизмы ферментативного действия аланиламинотрансфеназы

 

Общие черты активного центра:

1) А.ц. формируется из участков пептидной цепи и отдельных аминокислотных остатков, содержащих разные функциональные группы. Субстрат, соединяется с активным центром в нескольких точках; это обеспечивает высокую избирательность связывания (комплементарность субстрата и активного центра) и ориентацию субстрата и а.ц.) и ориентацию субстрата, необходимую для катализа реакции.

2) А.ц. как правило располагается в углублении (в нише, в щели) поверхности фермента. В результате субстрат, соединяясь с а.ц., оказывается не в водной среде цитозоля клетки, а в специфическом окружении функциональных групп а.ц.

В ходе присоединения субстрата и в ходе катализа происходят конформационные изменения молекулы фермента и субстрата. До взаимодействия пространственная структура структура субстрата и а.ц. лишь приблизительно соответствовали друг другу; строгая комплементарность возникает в процессе взаимодействия в результате изменений конформации (индуцированное соответствие). Конформационные изменения могут способствовать растягиванию разрываемой связи или, наоборот,сближению молекул при реакциях синтеза и тем самым вносят вклад в ускорение реакции.