Человек, в соответствии с философией Тибетской медицины, состоит из психологических (сенсорные и ментальные способности) и биологических (" три доша" и семь составляющих " лус зунг") единиц. На физическом уровне функции тела находятся в зависимости от активности " трёх доша" (трёх сущностей), нормальная работа которых жизненно необходима для поддержания хорошего здоровья. На более тонком уровне существует очень сложная взаимозависимость между биологической и умственной активностью. Например, чрезмерный гнев может вызвать или способствовать возникновению нарушений энергетических потоков нервной системы, что ведёт к патологии нервов и системы в целом. Тибетский врач знает об этой взаимозависимости. В отличие от тантрийских практиков, выносящих силу ума за пределы тела, врач исходит из учения о " трех сущностях" (три доша) или психологических процессах, а также об их влиянии на функционирование органов и систем тела.
Тибетская анатомия и психология содержит знания не только об основных органах и системах, но также о кровеносной и лимфатической системах. Насчитывается 11 основных органов; также как в Китайской медицине они делятся на плотные (позитивные) и полые (негативные). Каждый плотный орган находится в функциональной связи с полым органом. Например, печень, являющаяся плотным органом, ответственна за продуцирование крови, тогда как желчный пузырь - её поддерживающий орган - ответственен за хранение желчи, побочного продукта крови. Таким образом, органы формируют и поддерживают функционирование " семи составляющих тела", таких как; хилус (пищевая эссенция), кровь, мышцы, жировая ткань, кости, костный мозг и семя. С древних времён, Тибетские врачи различали связки, швы, лимфатические узлы, сосуды, нервные сплетения, соединительные оболочки,??? овую ткань и систему кровообращения. На протяжении многих веков для объяснения различных видов физиологической активности тела применялась тщательно разработанная теория взаимодействия энергий и " трёх доша".
В соответствии с Тибетскими текстами по анатомии - существует три основных энергетических канала в теле, по которъм осуществляется движение " ветра", " желчи" и " слизи". Черные каналы - это сосуды циркуляции крови. Каналы " ветра" - это центральная и периферическая нервная система, а белые каналы - лимфатическая система. Хотя, в Тантре Объяснений, содержащей разделы по анатомии и физиологии, три данных энергетических канала часто соотносят с тремя тантрическими каналами. Это часто вызывало некоторое недопонимание, что не давало возможности каждому лекарю объяснить разницу между медицинскими и тантрическими каналами. И только в работах Тибетских врачей после 16 века, три медицинских канала отделили от трёх тантрических каналов (" Чистое Зеркало" - текст по анатомии человека, написанный Тхогвонгом Сонам Таши). Текст Гухьяса-маджа Тантрараджа, написанный Дже Цонг Кхапой, подробно объясняет природу тантрических каналов как отличных от медицинских. Тантрические каналы не проявляются физиологически на грубом материальном уровне и, следовательно, они не функционируют активно у обычных существ. Только тогда, когда практикующий достигает Изначального Состояния (йоги или йоги-ни), он используя свою развитую психическую силу, способен открыть эти каналы как реально существующую структуру. У обычных существ эти каналы не проявлены, и только их грубые проявления, т.е. медицинские каналы - действительно функционируют в теле.
